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办理宅基地房权证是有标准化程序的，需要按照下列步骤去进行：
(一)农村居民申请宅基地的条件
农村居民申请宅基地必须符合下列条件：一是农村居民年龄必须年满十八周岁且符合分家条件；二是农村居民建房必须符合土地利用总体规划和土地利用年度计划及村镇建设规划；三是农村居民建房限额标准，使用原有宅基地和村内空闲地的限额面积为180平方米，使用农用地的限额面积为140平方米；四是农村居民建房必须“一户一基”；五是农村村民在出租，出卖原有的宅基地再申请宅基地的不予批准；六是严禁非农户和其他人员在本村购买宅基地。
(二)农民建房应当遵循的原则
农村居民建房应当使用原有的宅基地和村内空闲地，能够利用劣地的不得占用好地，能够占用荒地的不得占用耕地，使用国有土地的必须办理出让手续。
(三)农民建房申请宅基地的审批程序新
1、农村村民建住宅，首先向集体经济组织提出申请；
2、村集体经济组织对申请建房户在醒目的地方进行张榜公示(15个工作日以上)；
3、国土资源管理所及镇社会事务办公室到实地对申请人是否符合条件，拟用地是否符合规划等进行初审；
4、公布期满无异议后，将符合“一户一基”条件的用地户按规定报乡镇人民*审核后，报县人民*审批(占用农用地的按规定报市*办理农用地转用审批手续)。
5、宅基地批准后，国土资源所及镇社会事务办公室到实地批放宅基地，并发放选址意见书，规划许可证，施工许可证(“一书两证”)。
6、村民住宅建成后，国土资源所到实地检查是否按批准面积和要求使用土地，对符合要求的建房户核发集体土地使用证书。
7、村民凭土地使用证及规划许可证申请办理房屋所有权证
只有宅基地的土地使用证，宅基地是农村集体所有土地，是没有房产证的。
农村房屋也是可以办理房产证，但必需要按相关手续办理，才能办理房产证。。。
但需要土地手续齐全，修建审批，竣工验收，都是需要按有关手续办理齐全的，农村建房产也是可以办理房产证的。
但绝大部份农村的修房屋，都是由村上同意宅基地，修建不报批就进修房，这种房产是不能办理房产证的。
因为办理土地和报批是有委有多的手续，要经国土局，建管局（建委）审批，很复杂的。所以农村修房就不管了，只要村上同意，就修。