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通信与信息系统是通信专业的研究生专业名称，本科专业应该是通信工程。电子通信工程如果也说的是研究生的话，那一般都是指工程硕士，招的分比前面那个要低很多，学的东西也大多是以应用为主，应用性比较强，由于工程硕士是刚兴起的，还不是很被认可，而且一般学费也都是很贵的，一年学费都在八千到一万多，每个学校不一样，基本都没有奖学金，而且不少学校这两个专业师资也不一样，不在一起上课。
所以通信与信息系统要正规些，也难考，电子通信工程其实就是工程硕士，好考但是含金量没有前者高，学的东西其实二者都差不多，但是培养方向有很多不同。通信与信息系统一般方向都是些研究型的方向，工程硕士一般都是些市场上比较流行的应用方向，比如嵌入式之类的。每个学校都有自己特点，你去各个学校的招生简章上仔细看看就明白了。还有工程硕士是不能直接读博士的。
其实大多数学校的本科中通信工程和电子信息工程都是一样的。
电子与通信工程和通信与信息系统的区别：
信息与通信工程是一级学科，下设通信与信息系统、信号与信息处理两个二级学科。该专业是一个基础知识面宽、应用领域广阔的综合性专业，涉及无线通信、多媒体和图像处理、电磁场与微波、医用x线数字成像、阵列信号处理和相空间波传播与成像以及卫星移动视频等众多高技术领域。培养知识面非常广泛，不仅对数学、物理、电子技术、计算机、信息传输、信息采集和信息处理等基础知识有很高的要求，而且要求学生具备信号检测与估计、信号分析与处理、系统分析与设计等方面的专业知识和技能，使学生具有从事本学科领域科学研究的能力。
信与信息系统是二级学科，通信与信息系统（communication and information system）本学科所研究的主要对象是以信息获取、信息传输与交换、信息网络、信息处理及信息控制等为主体的各类通信与信息系统。培养具备通信技术、通信系统和通信网等方面的知识，能在通信领域中从事研究、设计、制造、运营及在国民经济各部门和国防工业中从事开发、应用通信技术与设备的高级工程技术人才。