应届毕业生已经在公司实习并签订了三方协议（还未正式毕业），档案由

这个公司的做法是不符合规矩的，是有意识的侵害毕业生的权益。三方协议是你没有毕业之前的预就业协议，也是确定毕业生与用单位之前就业关系的合法文书，一旦毕业生毕业，学校据此发放了报到证，用人单位必须立即与毕业生签订劳动合同，接收毕业生的报到并办理或者委托接收档案，并立即计算工龄，一年以后转正定级评定专业技术职称。

先把户口迁回家先；档案要么迁回家，要么寄存在你工作那个地方的人才市场。