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改报专业完全可以.
根据你描述的情况，无法具体判断你是属于基础课没过，还是专业课没过，所以我将可能的情况做详细说明：
一级建造师考试可分为三种情况:
1）第一种是考四科的,适合于首次取得资格的考试（我把它简称为“初考”，在没有拿到资格证书前的考试都称为初考，在没有取得认定资格、也没有取得一级建造师资格的人为取得资格而参加的考试)，科目为共设4个科目：《建设工程经济》、《建设工程法规及相关知识》、《建设工程项目管理》和《专业工程管理与实务》。其中《专业工程管理与实务》科目分为：房屋建筑、公路、铁路、民航机场、港口与航道、水利水电、电力、矿山、冶炼、石油化工、市政公用、通信与广电、机电安装和装饰装修14个专业类别，考生在报名时可根据实际工作需要选择其一。
参加4个科目考试的人员必须在连续两个考试年度内通过应试科目为合格；
2）第二种是考两科的,适合于免考部分课程的考试（我把它简称为“免考”），符合免考条件的人可免考两门（《建设工程经济》和《建设工程项目管理》），只需参加不能免考的两门课程（建设工程法规及相关知识》和《专业工程管理与实务》）考试即可，当年考试两个科目全部通过即为合格；
3）第三种是考一科的,适合于增加专业资格的考试（我把它简称为“增考”），参加考试的人只需要考一门（《专业工程管理与实务》），当年考试通过后即可申请增加专业注册。
你属于上述哪种情况，从你的提问中无法判断，所以只能将三种情况全部罗列出来，供你对照判断。
如果你是基础课通过了，而只有专业课没有过，那你改报市政专业后只需考《市政公用工程管理与实务》就可以了；
如果你是房建专业课通过了，而专业课没有全部过，那你改报市政专业后原来已经通过的专业课成绩就作废了，除了要考没有过的基础课外，还需考《市政公用工程管理与实务》就可以了；
可以改报专业，
一级建造师考试可分为三种情况:
1）第一种是考四科的,适合于首次取得资格的考试（我把它简称为“初考”，在没有拿到资格证书前的考试都称为初考，在没有取得认定资格、也没有取得一级建造师资格的人为取得资格而参加的考试)，科目为共设4个科目：《建设工程经济》、《建设工程法规及相关知识》、《建设工程项目管理》和《专业工程管理与实务》。其中《专业工程管理与实务》科目分为：房屋建筑、公路、铁路、民航机场、港口与航道、水利水电、电力、矿山、冶炼、石油化工、市政公用、通信与广电、机电安装和装饰装修14个专业类别，考生在报名时可根据实际工作需要选择其一。
参加4个科目考试的人员必须在连续两个考试年度内通过应试科目为合格；
2）第二种是考两科的,适合于免考部分课程的考试（我把它简称为“免考”），符合免考条件的人可免考两门（《建设工程经济》和《建设工程项目管理》），只需参加不能免考的两门课程（建设工程法规及相关知识》和《专业工程管理与实务》）考试即可，当年考试两个科目全部通过即为合格；
3）第三种是考一科的,适合于增加专业资格的考试（我把它简称为“增考”），参加考试的人只需要考一门（《专业工程管理与实务》），当年考试通过后即可申请增加专业注册。
参考资料：http://baike.baidu.com/subview/183125/183125.htm#9_2