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1.浸泡水洗法：
水洗是清除蔬菜水果上其他污物和去除残留农药的基础方法，主要用于叶类蔬菜，如菠菜、金针菜、韭菜花、生菜、小白菜等。一般先用水冲洗掉表面污物，然后用清水浸泡，浸泡不少于10分钟，对包心类蔬菜，要先切开，放在清水中浸泡1－2小时，再用清水冲洗，以消除残留农药。浸泡时若加少量洗洁精或果蔬清洁剂效果更佳。不过，因为一些农药渗透能力非常强，连根上都有，尤其是韭菜。所以，用浸泡水洗可能会洗掉蔬菜表面残留的农药，但对已渗透进蔬菜内部的农药却无能为力。
2.碱水浸泡法：
有机磷杀虫剂在碱性环境下分解迅速，所以此方法是去除农药污染的有效措施。可用于各类蔬菜瓜果。方法是先将表面污物冲洗干净，浸泡到碱水中(一般500毫升水中加入碱面5到10克)5到15分钟，然后用清水冲洗3到5遍。
3.加热法：
随着温度的升高，氨基甲酸酯类杀虫剂分解加快，所以对一些其他方法难以处理的蔬菜瓜果，可通过加热去除部分农药，如芹菜、豆角、青椒等。方法是先用清水将表面污物洗净，放入沸水中2-5分钟捞出。据试验，此法可清除50%-90％以上的农药残留。但此法容易损失蔬菜的营养。
4.使用专用洗涤剂:
这也是一种较为有效的方法，比较适合瓜果类蔬菜，一般可去掉50%以上的农药。但专用洗涤剂必须是质量可靠厂家的产品，清洗时也要冲干净洗涤剂，否则易产生二次污染。
5.去皮法:
有机磷、有机汞及菌酯类农药在水中溶解度虽然很低，但易溶于有机溶剂或蜡质液中，而蔬菜表面多有蜡质，很容易吸收农药。因此，对能去皮的蔬菜如丝瓜、南瓜等应先去皮后再食用。
6.阳光曝晒法:
利用阳光中多光谱效应，分解破坏蔬菜中部分残留农药。据测定，鲜菜、水果在阳光下晒5分钟，有机氯、有机汞农药残留损失达60％
7.储存法:
随着时间的推移，农药在空气中能缓慢地分解为对人体无害的物质。所以，对一些易于保管的蔬菜，可以通过一定时间的存放，来减少农药残留量。这种方法适用于冬瓜、南瓜等不易腐烂的品种，一般应存放10天以上。
根据实际情况，将以上几种方法联合使用会起到更好的效果。
买回来的水果、蔬菜要如何清洗最理想，可能是家庭主妇常有的困扰。清洗水果的目的，就是要将其表面的农药和污垢洗除干净。农药的种类很多，性质也不一样，但大致可分为水溶性和脂溶性两种。常有人以盐水或清洁剂来清洗蔬果，盐水可能对某些水溶性农药较易洗除，但对脂溶性农药反而洗不干净；清洁剂固然对脂溶性农药较清水有效，但洗完后反留下清洁剂余毒，还是得再用大量清水把清洁剂洗除。因此建议：蔬果的清洗以大量清水冲洗即可，因水溶性农药用清水即可洗除,而脂溶性农药以清水冲洗也可达到令人满意的程度。
此外，提醒水果食用上的注意要点：水果应先清洗后再剥皮（削皮）或切片食用，以色果皮附着的农药污染果肉。果皮亦含有丰富的营养，因此削皮食用的水果，尽量只要削除表面薄薄一层便可，以保留较多的养分。水果削皮或切片后，为防止其褐化，可洒上柠檬汁、凤梨汁或浸泡盐水。水果削皮（剥皮）或切开后，最好一次吃完，以保新鲜。 若无法吃完，可暂用保鲜膜包封后放入冰箱。