中国农科院农业政策研究中心主任、博士导师黄季昆认为，《中美农业合作协议》的签订是中国加入世贸组织的关键一步。从长远来看，中国加入世贸组织利大于弊；但在较短时期内，也会产生不利影响，主要表现在两个方面：
一是WTo规则的约束缩小了我国*对农业的宏观支持空间，我国将失去所有保护农产品的非关税手段，国内市场仅有关税这一唯一的保护措施，而且，我国还不具备将原有的非关税措施合法地转化为关税的机会。
二是国外农产品会对国内农产品生产形成一定的冲击。总的来看，有利与否，关键是中国*在产业政策、市场运行机制与监督管理、利益再分配等方面能不能尽快适应加入世贸组织所带来 的变化。
从农产品价格看，90年代以前，我国粮食和棉花的国内价格水平均低于国际市场水平，有较强的竞争优势。但近10年来，我国粮食生产成本平均每年以10％的速度递增，粮食价格也随之快速增长，小麦、玉米、大豆、棉花、油料、糖料等大宗农产品的国内价格已高于国际市场价格二至五成，在国际市场上失去了以往的竞争优势。但一些劳动密集型、有比较优势的行业如花卉、水果、蔬菜等只要在品种质量、加工、包装、销售等环节上多下一些功夫，在国际市场上将会有大的发展。目前，我国主要水果如苹果、鸭梨、柑桔的国内市场价格比国际市场价格低四至七成，有较强的竞争优势。蔬菜生产也是我国近几年发展起来的一项具有较强竞争力的产业，其出口量约为进口量的30倍，出口金额是进口金额的50多倍。从长期看，我国蔬菜行业的生产成本和价格在国际市场上将会保持相当 时间的竞争优势。
从宏观角度上讲，我国畜牧业的比较优势要强于种植业。目前，我国已步入世界肉类生产大国的行列，除奶类外，大部分畜产品价格均低于国际市场价格10％-40％。另外，我国现己发展成为世界上第一渔业生产大国，水产养殖和劳 动力资源部较为丰富，是其他国家不可比的。
在这同时，我们也应该看到，在国际市场上具有明显价格优势的国内农产品，出口水平仍然较低。比如我国的水果类产品，目前的年出口量仅占总产量的1％左右，每年都有大量的果品积压，果农蒙受了较大的经济损失。造成这种现象的原因主要是出口水果品种退化，产品结构不合理，不能保证全年供应和均衡上市。
黄季昆主任告诉记者，目前我国农产品出口还有着一定的局限性，出口量较小，出口市场还没有做到多元化，主要集中在华人居住区或周边一些国家和地区，如香港、澳门和独联体国家，这是一个特殊的市场。要想把这种优势产品市场扩大到欧美等国，却是相当难的。在这方面，不管是改府部门还是研究部门，部还重 视不够。
国内现在考虑的关税问题、市场准入问题，只是一个方面，更重要的是在生产、市场、加工等方面要有和贸易*化相配套的政策措施，尤其是在市场方面，如产品的等级标准、市场组织建设、市场中介绍织的培育、市场监督机制等。
其次，必须通过增加对农业科技资金的投入，以此来提高农产品质量，降低单位农产品生产成本。另外，通过提高农产品加工效益，强化农产品的产后商品 化处理和贮运手段，进一步挖掘其出口潜力。
加入世贸组织，对我国农民收入有促进作用，但有可能加剧贫富分化，对社会稳定有一定的影响，国家应尽快出台相关的配套政策，解决好利益再分配问题。
新加坡舆论认为，中国这次做出重大的让步，将可取得不小的经济利益，但也要付出巨大的代价。对于一个70％人口从事农业的大国来说，如果彻底开放农产品市场，其后果不堪设想。在这个问题上，应当采取逐渐开放的方式，以免因开放过快而引发社会问题。中国农产品市场的开放，短期来看，必然要带来一定的进口需求，小麦、玉米、大豆、食用油的进口量将有较大增长；而进口量的增加，将会导致国内市场价格下降，农民种田变得无利可图或者是获利减少，尤其是小麦、玉米和大豆的主产区----华北地区，有可能造成农民大量失业、社会不安定的局面。黄季昆主任认为，这其中最应引起重视的问题是，受不利影响的绝大多数是穷困农民，是那些单纯靠种粮食赚钱的农民。国内农产品市场放开后，粮食降价赚不到钱，原先比较富裕的农民，有资金、有能力转到蔬菜、花卉等能赚钱的行业，而原来就比较穷困的农民，由于资金、技术和市场信息等条件的限制，获利机会只会更少。
这样，就会导致穷者愈穷、富者愈富，贫富分化愈来愈严重。在这方面，*应制定相应政策，提供市场信息、资金扶持，推广农业新科技，帮助这部分农民从粮食作物种植转到非粮食作物种植上来，从种植业转到非种植业上来，把不利影响降低到最低程度。从某种意义上说，解决好这一利益再分配工作，是*应该 考虑的大问题。
从长远来看，由于我国目前70％的粮食产量是自给性的，多用于口粮，农民的商品粮收入有限，不可能通过少量的粮食买卖来大幅度增加收入，因此，加入世贸组织，对农民收入的影响不会太大，一定程度上还有促进作用，主要表现在两个方面：一、原先从事种植业的农民可以转到非种植业上来；二、加入世贸组织后，工业、商业等领域就业机会的增多，也可以使农民从农业转到非农行业上来，以获取更大的利益，增加收入。此外，还有利于我国农业有效地利用国际经济资源和国际市场，有效地促进经济增长方式的转变，加快农业结构调整。通过加强国内生产与世界农产品市场的结合，也可以广泛引入国际竞争机制，为我国农业生产经营*改革创造外部环境，有利于我国利用外资、引进技术改造传统 农业。
国外农产品的进入，对中国粮食影响最大的应是玉米，这是一个不容忽视的问题。“粮食安全”不应成为制约我国政策调整的决定性因素，如果适当增加农 业投入，即使放开市场，粮食自给率仍可达90％，甚至达到95％。
黄季昆主任认为，中国农产品市场开放后，影响国内粮食需求最大的是小麦和玉米，现在社会上普遍关注的是小麦，对玉米的影响被忽视了。从目前看，我国小麦的人均消费水平再增长的潜力不是很大，我国的人口增长率已经下降到1％以下，通过人口增长带动的小麦消费需求也不会有太大的增长。另外，通过推广农业新技术；小麦单位面积产量的提高速度不会比人均消费量的增长速度慢。因此，小麦的进口量在经过短时期的增长后将逐步趋于平衡。随着农民收入的增长，城市化的发展，人们生活质量的提高，对畜产品的需求将会增多，相对应的是饲料粮的需求量必然增长。由于社会结构和消费方式的不同，我们目前消费的主要畜产品不是牛肉和羊肉，而是猪肉，所以，饲料粮的相当一部分要来自玉米、红薯等。现在国内市场上的玉米价格比国际市场价格要高20％以上，国内生产还不如进口，这是现实情况。从这方面看，在放开市场后，到21世纪初，我国玉米的进口量可能达到2000万吨----4000万吨，玉米将成为我国进口量最大 的粮食作物，是粮食进口里面最大的一个问题。
在我国粮食价格已经显著高于国际市场价格的背景下，我国粮食贸易方针的调整，应该着眼于以下几个方面:第一，从认识上说，不应把农业或食物过于简单地等同于粮食。在*化贸易环境下，我国在大宗的劳动密集型食物产品上具有竞争优势，有可能通过扩大出口产生一个正面的收入效应。应当在这一根本性问题上形成正确判断并澄清一但粮食*化，我国注定要从国外进口所需要的大部分粮食的误解。此外，还应鼓励对粮食进口替置的粮田在农业生产范围内加以利用，以求在提高耕地利用效率的同时，储备粮食生产能力，增强抵御风险的能力。