专业合作社开具免税的农产品能按3%税率开具吗

既然专业合作社开具免税的农产品，当然就不能能按3%税率开具了，农产品免税政策是全免，和小规模纳税人有收入限额性质不同。

税率这一列填写税率13%是正确的。与对方约定好的价格是含税价，不是不含税价。对方收到发票后是按价税税合计乘以13%。如果开具的发票中有税额一栏的，按发票中所含的税额抵扣。