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关于印发《建筑工程安全防护、文明施工措施费用及使用管理规定》的通知http://www.*rd.gov.cn/wjfb/200611/t20061101_158036.html
朋友，一般来说合同中如果未明确安全文明施工费用的，百分比付款中是应该包含在内的。因为工程总价中已含了安全文明施工费，即是按照进度比例支付了。
但是如果不符合相关规定（打达不到规定比例）的，可以提出再支付。
《建筑工程安全防护、文明施工措施费用及使用管理规定》第七条 建设单位与施工单位应当在施工合同中明确安全防护、文明施工措施项目总费用，以及费用预付、支付计划，使用要求、调整方式等条款。
建设单位与施工单位在施工合同中对安全防护、文明施工措施费用预付、支付计划未作约定或约定不明的，合同工期在一年以内的，建设单位预付安全防护、文明施工措施项目费用不得低于该费用总额的50％；合同工期在一年以上的（含一年），预付安全防护、文明施工措施费用不得低于该费用总额的30％，其余费用应当按照施工进度支付。
实行工程总承包的，总承包单位依法将建筑工程分包给其他单位的，总承包单位与分包单位应当在分包合同中明确安全防护、文明施工措施费用由总承包单位统一管理。安全防护、文明施工措施由分包单位实施的，由分包单位提出专项安全防护措施及施工方案，经总承包单位批准后及时支付所需费用。