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1、利率：商贷首套基准5.9（5年以上），可能会有折扣，视你当地商业银行政策来定。公积金贷款利率4（5年以上）
2、额度：商贷一般没有额度限制；公积金额度按照你们当地公积金网站公示为准，一般是120万上限（首套）
3、收入：商业贷款对客户收入界定相对宽松；收入覆盖贷款月供两倍就可以（用还款计算器可以计算）；公积金贷款根据公积金考量客户还款月供能力（公积金网上会有相对应的查询公式）
4、申请：商贷直接到当地商业银行申请，提交材料即可；公积金贷款只能到当地公积金管理中心办理。提交材料不同。可在公积金网站查询。
5、公积金贷款额度不够的情况下，可以申请办理组合贷款：不足的部分办理商业贷款，相应的材料需要准备两份，周期较长，资料较多，同时也不保证能够申请下来。
6、额度最大、折扣最大的情况适用于商贷，公积金是死公式，无法更改。且没有折扣。
住房公积金管理各地具体管理不同，其他地方不清楚，成都市参考如下：
缴费基数：根据国务院《条例》规定，职工个人住房公积金缴存基数为职工本人上一年度月平均工资，职工工资总额以国家统计局职工工资总额指标解释为准；新录用或新调入的职工缴存基数为录用或调入当月职工本人工资总额。（工资总额计算口径：按照统制字【1990】01号文件的规定：职工工资由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工资和计件工资组成。）
缴费比例：根据成公积金委[2008]2号的规定，自二〇〇九年一月一日起成都住房公积金的缴存比例按以下标准执行：财政拨款单位、国有企业和国有控股企业缴存比例不得高于12%，其它单位缴存比例超过12%的部分，应按国家税收政策规定纳税；缴存比例下限不低于6%，缴存比例低于6%的单位，应按照困难企业申请降低缴存比例的条件进行申请，经公积金中心审核，报管委会批准后执行。