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水机是指管路（包括房间）是走的经制冷（或制热）后的水，也就是说是以水为载体的系统。
反之是以制冷剂（氟利昂）为载体的系统。
氟机优点：
1、管径细、占用空间少，安装方便；
2、由于氟管直接到房间，而且温度低（高），所以制冷、制热速度快。
3、由于氟管可以房间单独控制（变频控制），所以省电节能。
氟机缺点：
1、由于氟管温度低（高），吸收空间水分的能力强，所以舒适性差（干燥）。
氟机适合需要随开随关的场所，如住宅、办公室等场所。
水机缺点：
1、管径粗、占用空间大，安装不方便；
2、由于水机是需要主机把水管里的水首先制冷，再把制冷后的水通到房间，所以制冷制热速度慢。
3、因为水管机的控制为集中控制，无法与氟管机那样完全单独（或变频）控制（辅助设备多），所以耗电量较大。
水机优点：
1、由于水管温度比氟机温度高，所以吸收水分量较少，所以舒适性好。
水机适合长时间开启的大型场所，如宾馆、商场、车间等场所。
1、水系统*空调在冬季采暖时可以与市政热水相连接，有市政热水采暖，此时空调室外主机不工作，不但可以节省采暖费用还不受室外温度的影响。氟系统*空调冬季采暖时，热量主要来源于室外空调主机，室外主机的制热效率会随着室外环境温度的降低而衰减，当室外机温度低于一定的温度时，空调主机会停机。
2、水系统*空调的动力来源于自选的水泵，因此不受管路长短的限制。氟系统*空调的动力来自于压缩机，因此有一定的管长及落差限制。
3、水系统*空调因靠水泵来循环，对内外机容量的匹配没有限制。氟系统*空调内外机容量的匹配有限制，通俗理解也就是虽然室内机同时使用率很低，但室外机仍要配一个相对较大的匹配型号。
4、氟系统*空调，为变频机组，其能量调节范围宽广、精确，要比水系统空调节能。
5、氟系统空调内外机有信号线连接，可以精确的控制室内温度；水系统空调主机不能检测室内温度，对室温控制的幅度相对要大一些。
6、氟系统管路里走的是冷媒，不怕冻，不会产生细菌，维护简单；水系统管路里走的是水，容易结垢、生锈及跑、冒、滴、漏现象，且冬季要做防冻处理。