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目前生物除臭法技术在国内外的应用越来越广泛，但由于生物法是一种新兴的除臭技术，在使用条件及运行管理上还受到一些限制，并且针对我国复合型的环境空气污染，恶臭成分比较复杂，生物法去除恶臭气体还有许多尚待解决的问题，主要表现为：
(1)生物滴滤池在长期运行中的有机物浓度较高，易导致生物量的过度积累，造成填料层堵塞，使整个压降增大导致系统瘫痪；
(2)需要研究提高降解污染物的微生物活性，深入研究除臭菌种的除臭机理与共生协同关系，并且研究可以同时去除不同恶臭的多效除臭菌种；
(3)针对恶臭废气成分复杂的特点，需要开发能同时去除多种恶臭污染物的生物技术；
(4)需要对系统的运行参数进行优化设计，提高处理效率，同时降低处理成本；
(5)研究开发生物法与其它技术综合应用的一体化设备。