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从医学整体实力方面，肯定是第四军医大学要更强一些，其学科面比较宽。第四军医大学拥有医学类国家重点学科数量是15个，加上正在培育的4个接近20个国家重点学科；而西交大拥有的国家重点学科是两个。
不过，二者拥有的优势学科有所不同。西交大的两个国家重点学科是法医学、泌尿外科；而第四军医大学的重点学科分别是神经生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、人体解剖与组织胚胎学、病原微生物学、病理学与病理生理学、内科学（消化系病）、内科学（传染病）、外科学（骨外）、外科学（神外）、外科学（胸心外）、皮肤病与性病学、口腔临床医学、军事预防医学、航空、航天与航海医学。此外，第四军医大学的影像医学与核医学、外科学（普外）、外科学（整形）等也接近国内顶尖水平。
考生可以根据想学哪方面专业去考虑。
还有，就是第四军医大学属于军校招生，是提前批录取，毕业后包分配。而西交大一般是在本科一批招生。也就是说，考生可以在提前批报考第四军医大学，然后在本科一批志愿中同时填报西交大，增加录取几率。
PS：录取到西交大和第四军医大学任何一所都不错。
其实，个人建议还是去军医大学吧 西安交大是985不错的 医学不如军医大学 而且军事化管理 认可度很高
第四军医大学在医学方面的实力远在西安交大医学院之上，录取分差不多，四医大可能还高点。
西安交大
西安交大医学院好，但第四军医大学很难考。