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公积金扣款失败会进行第二次扣款的。
公积金贷款扣款手续是银行设置好的自动扣款业务，只要在第一次没有扣款成功的情况下，系统会自动发起第二次扣款。简单来说，无论是银行商贷还是公积金贷款，扣款都是电脑系统自动扣款的，第一次扣款不成功的，稍后还会再扣一次的。
1、首先需要说明的是在合同中约定的是扣款日，该日期指的是每月银行从您还款账户中划款的时间，您应当迟于还款日的前一天将还款额足额存入还款账户中，如果扣款日当天存款容易造成逾期。
2、如果是*还款方式，借款人偿还逾期个人贷款，可通过两种方式进行操作：
(1)借款人在合同约定的还款日偿还逾期个人贷款，可先通过呼叫电话委托系统查询到下一还款日至少应偿还的贷款金额(该金额应为逾期贷款本息、罚息及低还款额之和)，即借款人若按此金额在下一还款日还款，则贷款不再逾期。
借款人再通过呼叫电话委托系统或到贷款业务部门签定《借款人调整月还款额通知书》确定下一还款日的还款额。
(2)借款人在非合同约定的还款日偿还逾期个人贷款，须持本人身份证原件到贷款业务部门柜台办理相关手续。借款人先向贷款业务部门提出申请，设定一个约定还款日，约定还款日的范围为：借款人到管理部办理还款手续的三天(不含)后至下一个合同约定还款日(不含)之前。
但借款人每期只能到柜台办理一次非合同约定还款日逾期个人贷款偿还手续。借款人填写《偿还逾期个人住房担保委托贷款承诺书》(一式两份，个人和贷款业务部门各持一份)。
如贷款职工签订的委托逐月提取还贷协议在生效期间，遇到住房公积金年度基数调整，公积金月缴存额度发生改变的，在逐月扣款操作时，除职工公积金缴存账户须保留不少于签订协议时月缴存额的12倍余额外。
扣款日将由公积金系统自动从新调整后的月缴存账户中划转大于规定余额的月缴存额用于偿还公积金贷款。如公积金账户中除须保留的余额外月缴存额不足一个月的则不予操作，直至账户满足扣款条件后再操作。
扩展资料：
公积金贷款后办理房产证方法：
如果买的是一手房，办理房产证流程如下：
1、签订委托协议：通常《购房合同》中有关于委托开发商代办房产证的条款，这个条款本身就可以看作是一份单独的委托协议。
2、缴纳各种费用：缴纳房产证代办费、公共维修基金、契税、印花税，办理收房入住手续的时候，开发商往往会要求缴纳这些费用。
3、按照约定时间领取房产证：开发商或代理公司代交上述税费之后，申请办理房产证，并办理抵押登记后，就可以领取房产证了。
参考资料：百度百科-公积金贷款
各城市公积金贷款的扣款时间等扣款规则有所差异，具体扣款规则请咨询办理贷款的公积金中心或工行经办支行。为确保足额扣款，建议您在还款日前尽早将还款资金汇入还款账户，还款日在还款账户中保留足够余额。
（作答时间：2020年3月22日，如遇业务变化请以实际为准。）
会不会我也不清楚。。。
不会扣两次。