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SATA 3Gbps和SATA 6Gbps的区别主要是硬盘的读写速度不同，不过需要对应的主板支持才可以，如果使用SATA 6Gbps的硬盘，那么主板必须有有对应的SATA 6Gbps硬盘接口才可以，因此，组装电脑的时候选择SATA 3Gbps或SATA 6Gbps的硬盘取决与选配的主板。
另外一点，SATA 3Gbps和SATA 6Gbps在5400转和7200转的硬盘的性能差距体现不是很明显，主要还是在固态硬盘的使用中有比较明显的效果，固态硬盘的实际读写性能远超SATA 3Gbps的硬盘接口传输标准，因此SATA 3Gbps将成为限制固态硬盘性能的瓶颈，更换成SATA 6Gbps可有效提高固态硬盘的性能。
一般支持SATA 6Gbps硬盘的主板上，SATA 6Gbps硬盘接口的数量少于SATA 3Gbps的硬盘接口，可以选择一些SATA 6Gbps的固态硬盘做系统或者软件应用。
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