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其实，连花清瘟胶囊/颗粒是兼具治疗普通感冒和流感的药物的，因普通感冒90%以上是病毒传播引起，以鼻病毒为多。临床表现多为喷嚏、流涕、发热或不发热、咽痛、咳嗽，连花清瘟辛凉解表、发散风热作用，可以迅速改善打喷嚏、流鼻涕；清热解毒、宣泄肺热作用，可以消除发热、咽喉疼痛、咳嗽咳痰等症状；提高机体免疫机能的特性，可以防止感冒病程迁延。
而发挥这些作用的根本是连花清瘟具有的多靶点效应，既抗普通感冒病毒、抗炎、抑菌，还能止咳化痰，所以我们在感冒服用连花清瘟后都有这样的体会，伴随着咽喉部清凉的感觉，发热、咽痛、咳嗽都解决了。
另外，广州呼吸疾病研究所、中国军事医学科学院、中国中医科学院等科研院所基础研究证实，连花清瘟具有整体调节、多靶点发挥作用的优势：明显抑制SARS、甲型流感H1N1、H3N2、禽流感H5N1、H9N2、H7N9等多种病毒；有效抑制多种细菌，有利于治疗混合感染；退热抗炎，止咳化痰；调节免疫，增强抗病康复能力，减少流感及肺部感染的反复发作，显示出多靶点、整体调节的特色优势。
此外，连花清瘟从2003年进入市场至今，已经获得国家层面20余次方案推荐，从甲型流感、乙型流感、禽流感到新型冠状病毒性肺炎，在这十几年我国发生的病毒传染性重大公共卫生事件中，连花清瘟都获得了治疗方案推荐。连花清瘟胶囊的科研成果获得了2011年度国家科技进步二等奖，这是其他药物所不具备的优势。