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建议先自行垫付医药费，然后到劳动部门申请工伤认定，工伤认定之后，由用人单位支付相应的补偿。
《工伤保险条例》第十七条 职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
如果经过治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应当申请劳动能力鉴定，向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请；
根据不同的伤残等级，获得的补偿是不一样的。主要的补偿是：医疗费、一次性伤残补助金、一次性就业补助金、一次性医疗补助金、停工留薪期工资、伙食补助费、护理费等。
现在看来这个协议是个大问题，且内容肯定于你不利，但是你可以走劳动关系，要求认定是工伤，走劳动关系这个路子还是可行的，建议去当地律师事务所咨询一下律师，家庭困难可以申请法律援助，当地律师事务所一般都有这项服务。
你还是找律师咨询吧。事情太过复杂，迅速找律师处理，别耽误了。
包工头是没有希望了，只能找分包方。