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舒张功能减低、心肌缺血、流出道梗阻、心律紊乱和植物神经功能异常是肥厚型心肌病基本病理生理过程，由此而导致相应的临床症状和体征。
1 气短/呼吸困难：乏力和气短导致活动能力下降。心脏舒张功能异常是肥厚型心肌病患者共有的病理过程。原因在于过度肥厚的心肌弛张期延长和顺应性下降，心肌缺血、室壁张力增加和心律紊乱也是加重或诱发舒张功能不全的重要因素。
2 胸痛：常常是劳累诱发，休息缓解，但疼痛可发生在休息、睡眠时，也可呈持续性。产生疼痛的原因与心肌缺血有关。合并冠状动脉狭窄，心排出量减少、室壁张力增加，氧耗量随之增加等也是重要的原因。
3 心悸：心律不齐较常见，但出现心率过快或过慢伴头晕、出汗时应引起重视。
4晕厥：即出现眩晕、严重的短暂意识丧失。导致晕厥/近晕厥原因可能是：
A.心室腔内梗阻导致的心输出量减少，血压下降；
B.严重的心律失常，包括过快、过缓性心律。
C.植物神经功能异常，主要表现为迷走神经张力过高引发的心动过速，外周血管扩张，导致低血压。