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在生物滤池中，填料既是微生物生长的载体，又是气相和液相之间传递的介质，所以说填料是装置的核心之一。填料的种类和特性对臭气的去除效果有着显著的影响，而一般理想的填料具有如下几个特性：
1、高比表面积，为微生物的生长提供较大的生长附着面积。
2、表面湿润性好，滤料还需具有一定的持水能力，为微生物的生长提供适当的液态环境。
3、具有一定的机构强度。
4、具有一定的防腐能力。
5、材料价格便宜且容易得到。生物滤池的填料一般分为有机填料和无机填料，有机填料本身具有有机养分，能为微生物的生长提供养料，而无机填料本身无养分，但是其结构性好，防腐能力强，可以持续使用，需要适时喷淋有机养分以便为微生物的生长提供必要的营养和液态环境。有机填料主要有土壤、泥炭和木屑等，无机填料主要有天然卵石、竹炭、木炭、陶粒、火山石、塑料等。