装系统和4K对齐这两件事情其实是可以同时进行的，因为用Windows 7及以后的系统，安装时自带的分区工具在分区时，会自动帮你4K对齐的，所以对新硬盘安装Windows 7和Windows 10系统时直接用安装盘就好了，Windows XP的话要把分区配置单元设置为4096字节。
问题主要问的是先后，其实新买的硬盘无论要做什么，都是先分区。
如果整个硬盘作为一个分区的话，在装系统时直接选择那个“未分配空间”然后再点安装系统，就会自动把那里作为一个分区了。
4K对齐是不需要在意的，无论是用DG还是在系统安装的界面上分区还是强迫症用diskpart 分区，默认都是4K对齐的。
回答这个问题之前，我们先了解一下为啥要4K对齐。
为何一定要4K对齐？
固态硬盘组成部分主要有三个：主控芯片，DRAM缓存和NAND闪存。其中，NAND闪存是固态硬盘实现数据存储真正的介质。
P/E Cycle，写入/擦除次数，是判断NAND寿命的关键参数。如果要延长NAND的寿命，就需要降低P/E Cycle。而4K对齐的目的，就是最大程度地优化数据存储，减少对NAND的写入/擦除算次数。也就是说，4K对齐关乎这个固态硬盘的寿命。
为了便于理解，我们可以再举个简单的例子：如果说固态硬盘是一个仓库的话，那么，固态硬盘硬盘中的存储块(Block)就类似于仓库内的分割好的小房间。假设小房间的存储空间是4K的整数倍，小房间的使用寿命是10万次。但是，如果，放入小房间的物品都是非4K对齐的，那么，必定会多占用小房间，浪费一部分的存储空间。
4K是否对齐，对固态硬盘的随机性能影响很大。比如下图，4K对齐前后，随机写入性能从6MB/s直接提升至105MB/s.
所以，在安装系统前，最好还是先进行4K对齐。
新的硬盘是还没分区的，而要先分区才能安装系统。4k对齐是分区时和容量，卷标等一同设置的参数之一，这些参数想要在硬盘有数据时更改会比较麻烦，因此建议：新的固态，先分区，在分区的时候块大小设置为4096，即4k后，再进行系统的安装。另外格式化的时候一般默认是4K对齐的，如果不清楚是不是对齐可以用软件检测一下。AS SSD Benchmark这个软件可以检测。出现图中红圈的样子就是对齐的。
先4k对齐，至于为什么要4K对齐，原因有三。
一是：规范字节数，原来规定的每个扇区512字节改为每个扇区4096 个字节，按照每扇区4K 的规则写入数据。
二是：数据读取规范，避免造成跨区读写，读写次数放大大，影响读写速度。
三是：写入次数有限，如果4K不对齐，性能会下降，寿命也会缩短。（可参考第二点）
可利用pe自带的dg软件进行4k对齐，利用AS SSD Benchmark软件进行检查如果全城飘绿这代表已对齐。
4K对齐优先，因为这决定了你所有文件的读写速度和碎片化产生是直接对使用体验的影响，之后再装系统。通常是硬盘格式化将其分区时选择对齐、接着正常安装即可、其实个人觉得分区只需要两个足以，一个系统盘一个数据盘，简单高效……
回答这个问题之前，我们先了解一下为啥要4K对齐。
为何一定要4K对齐？
固态硬盘组成部分主要有三个：主控芯片，DRAM缓存和NAND闪存。其中，NAND闪存是固态硬盘实现数据存储真正的介质。
P/E Cycle，写入/擦除次数，是判断NAND寿命的关键参数。如果要延长NAND的寿命，就需要降低P/E Cycle。而4K对齐的目的，就是最大程度地优化数据存储，减少对NAND的写入/擦除算次数。也就是说，4K对齐关乎这个固态硬盘的寿命。
为了便于理解，我们可以再举个简单的例子：如果说固态硬盘是一个仓库的话，那么，固态硬盘硬盘中的存储块(Block)就类似于仓库内的分割好的小房间。假设小房间的存储空间是4K的整数倍，小房间的使用寿命是10万次。但是，如果，放入小房间的物品都是非4K对齐的，那么，必定会多占用小房间，浪费一部分的存储空间。
4K是否对齐，对固态硬盘的随机性能影响很大。比如下图，4K对齐前后，随机写入性能从6MB/s直接提升至105MB/s.
所以，在安装系统前，最好还是先进行4K对齐。
建议用U盘刻录原版系统，然后，设置U盘为第一启动盘来安装，安装时，先格式化固态硬盘，就会自动对齐了。
如果是旧硬盘而且上面有分区的话，当然也可以用系统安装盘重新分一次区并格式化，装系统时原来的C盘当然会铲掉，不过如果其他盘有数据又忘记搬走的话可以选择装好系统后再经行除了，装好系统后把那些东西搬到别的硬盘上再把这些分区删除重新格式化即可，如果不想搬数据的话还有别的方法。
直接可以安装系统，所谓4k对齐，系统会在安装过程给你对的。
固态硬盘分区的时候会4K对齐，分好区后安装系统就可以，了解更多电脑知识，可以到装机员网站看看